Фуншал, як і весь острів Мадейра, знаходиться у зоні субтропіків. Для погоди Фуншала характерне помірно спекотне літо та дощова зима.
Погоду в Фуншалі з червня до серпня навряд чи можна назвати непередбачуваною: якщо прогноз на тиждень або 14 днів обіцяє температуру +23–25°С, то, швидше за все, так воно й буде.
Відмінною рисою погоди Фуншала є відсутність відчутної різниці у показниках температури повітря та води, особливо восени та взимку. Так, з січня до березня протягом 3 або 5 днів температура води і повітря може бути приблизно однаковою — близько +15–18°С.
Середньорічні показники температури повітря в Фуншалі коливаються від +18 до +23°С, температури води в Атлантичному океані - від +17 до +23°С.
Рослинність і тваринний світ Фуншала
Мадейра - це скарбниця реліктових рослин. Близько 20% площі острова покриває лаурісилва — унікальний доісторичний ліс лаврових дерев, що знаходиться під охороною ЮНЕСКО. Також серед найпоширеніших рослин острова і безпосередньо Фуншала — мохи та папороті. Цікаво, що з різноманіття рослин близько 120 видів є ендемічними, тобто зустрічаються лише тут.
Щодо Фуншала, то він цілий рік потопає у квітах орхідей, магнолій та азалій. Проте символом міста вважається ароматний дикий фенхель, який тут зростає на кожному кроці.
З представників фауни у Фуншалі найчастіше можна побачити голуба Columba trocaz та ящірок. З мешканців морських глибин найчастішими гостями прибережної зони є риба-шабля чорна, риба-ящірка та морські черепахи.