Найпопулярніший вид розваг на воді в Іракліоні — віндсерфінг, що пов'язане із постійними хвилями на північному узбережжі Криту. Улюблене місце серферів — пляж Малія (приблизно за 35 кілометрів від Іракліону), там розташований центр водних розваг Dolphin Water Sports.
На пляжі Амудара, поряд з готелем Dolphin Bay Hotel, знаходиться школа віндсерфінгу.
Галечний пляж Палекастро (12 кілометрів від Іракліону) ідеально підходить для дайвінгу - тут глибоке та дуже чисте море. Великий дайвінг-центр (European Diving Institute) знаходиться в селі Агія Пелагія.
Покататися на водних лижах та взяти уроки вейкбордингу в Іракліоні можна на пляжі Амудара (30–50 EUR за 3,5 кілометри). Там же можна орендувати каное або зайнятися снорклінгом (10–15 EUR).
