Головна особливість клімату Іракліону — непостійність. Так, з кінця березня до листопада перебіг температур становить від +22 до +35°С, взимку протягом одного дня стовпчик термометру може опускатися з +18°С до +10°С. Літо в Іракліоні дуже сухе і спекотне (на гірських околицях міста трохи прохолодніше), зима м'яка, але з постійними дощами. Порівняно з іншими курортами міста, середні зимові та літні температури в Іракліоні на 2–3 градуси нижчі, ніж на півдні (а ось температура моря на Криті скрізь приблизно однакова).
Рослинність та тваринний світ Іракліону
Живності в Іракліоні небагато: кішки, собаки та галасливі цикади в чагарниках олеандрів. За більш екзотичними представниками фауни треба їхати до околиць. Наприклад, у горах тваринний світ Іракліону «представляють» дикі козли, борсуки та безліч ящірок, якими буквально кишать скелі. Набагато різноманітніша рослинність Іракліону (оскільки Крит — це острів, тут сформувалася окрема екосистема). Типова місцева рослинність — кипариси (колись з іракліонської деревини створювали кораблі для єгипетських фараонів!), пальми, найбільші в Європі платани, фруктові дерева та акації.
