Найпростіший спосіб доїхати до центру міста — скористатися міською електричкою S-Bahn, станція якої розташована прямо в центральній будівлі аеропорту.
Поїзди на лініях S1 та S8 ходять кожні 20 хвилин, а квиток Airport-City-Day-Ticket, яким можна користуватися на всіх видах міського транспорту протягом одного дня коштує 12 EUR.
Також до послуг гостей Мюнхена пропонуються автобуси, які кожні 20 хвилин курсують від обох терміналів та головного центру в період з 6:25 до 22:25. Схема аеропорту підкаже, де знаходяться стоянки таксі, проїзд в якому коштуватиме туристу приблизно 60 EUR. Крім того, в будівлі аеропорту розташовані компанії, які пропонують прокат автомобілів.
